2016年清明小长假为4月2日—4月4日，常州国际机场实现旅客吞吐量1.32万人次，货邮吞吐量88.2吨，完成航班运输起降124架次，共通航22个境内外城市，其中国际（地区）航班有名古屋、台北、万象、首尔，各执行一班。

4月1日(假期前一天)的旅客吞吐量较高，为5351人次，4月2日的客流量有所下降，其后两天略有回升且趋于平稳，符合节假日惯有的“两头高，中间低”的特点。国内航班中，重庆、成都、厦门、广州、珠海、哈尔滨等航线的客流量较高；国际（地区）航班中，名古屋航线最高客座率突破90%。